18+18+Сюжет сериала продолжается на том же месте, где закончился первый сезон: жители Уэйуорд Пайнс борются против железной хватки Первого Поколения. Доктор Тео Йедлин — новый житель города — просыпается после анабиоза и оказывается в самой гуще этих событий, пытаясь понять, что из себя представляет Уэйуорд Пайнс, и спасти человечество, оказавшееся под угрозой истребления.
Пытаясь найти смысл своей новой жизни в Уэйуорд Пайнс, Тео обнаруживает свою ценность, оказавшись единственным хирургом в городе, и использует своё преимущество, чтобы найти ответы на многочисленные вопросы к лидеру Первого Поколения, Джейсону Хиггинсу: о своей жене Ребекке и о самом городе. Си-Джей Митчем — единственный, кто может построить мост между нынешним миром Уэйуорд Пайнс и предыдущим миром, в котором жили люди.
В серии ретроспективных кадров мы узнаем, как и почему Джейсон Хиггинс стал лидером Первого Поколения и любимым чадом Уэйуорд Пайнс. Между тем, сестра Пэм вновь появляется в городе и представляет собой смертельную угрозу для него, а Тео продолжает поиски информации, которая помогла бы ему понять, почему он был выбран на роль одного из жителей этого города.
Оказавшийся по ту сторону забора конце первой серии Ксандер возвращается в Уэйуорд Пайнс, приведя с собой неожиданного спутника, который помогает ему узнать больше о намерениях Эбби. Между тем, Ребекка идёт наперекор Меган, чтобы помочь Люси — девочке, которая пытается избежать традиции города, а Си Джей ведёт группу отважных людей в экспедицию за пределы забора, чтобы заявить о требованиях человечества на Землю, вопреки протестам Тео.
История создания города раскрывается, когда Ребекка вспоминает свою первую встречу с Пилчером в роли архитектора. Тео в ужасе от тайны, которую раскрывает ему Ребекка, Тереза говорит Си Джею и Адаму, что хочет жить по ту сторону охраняемых границ, а Меган ставит эксперимент на первой пойманной особи Эбби женского пола.
Эбби нападают на СиДжея и собирателей, из-за чего Тереза оказывается в серьёзной опасности, а городу грозит голод. Тео собирает самодельный блок сортировки, но починить свой брак с Ребеккой у него не получается. Ксандер доказывает, что всё ещё готов бороться, когда Джейсон начинает сомневаться в его лидерских качествах.
Тео и Меган спорят по поводу ресурсов Эбби, а доктор пытается связаться с их лидером. Недооценённая опасность приводит к смертельным последствиям. СиДжей вспоминает о своей жизни и огромных возможностях, которые у него были.
Тео объединяет усилия с Хасслером, чтобы выследить сбежавшего лидера Эбби; Ксандер спорит с Ребеккой по поводу её состояния, а Джейсон узнаёт нечто ужасное о Керри.
Пилчер вспоминает о поисках своего Избранного. Между тем, Эбби приближаются; Джейсон принимает фатальное решение, и Ксандер должен отбросить разногласия между ними, чтобы остановить его, прежде чем человечеству придёт конец.
Эбби надвигаются на город, и Тео вынужден принять решение, которое определит судьбу человечества.
